• facebook
  • linkedin
  • youtube

Apre savan Ameriken an Eric S. Lander te pwopoze fòmèlman polimorfis nukleotid sèl (SNP) kòm makè molekilè twazyèm jenerasyon an 1996, SNP te lajman itilize nan analiz asosyasyon ekonomik, konstriksyon kat jeyografik byolojik lyezon jenetik, ak tès depistaj jèn patojèn imen., Dyagnostik ak prediksyon risk maladi, tès depistaj dwòg endividyèl, ak lòt domèn rechèch byolojik ak medikal.Nan domèn elvaj rekòt lajan kach, deteksyon SNP ka reyalize seleksyon bonè nan karakteristik ki nesesè yo.Seleksyon sa a gen karakteristik segondè presizyon epi li ka efektivman evite entèferans mòfoloji ak faktè anviwònman an, kidonk anpil diminye pwosesis elvaj la.Se poutèt sa, SNP jwe yon gwo wòl nan domèn rechèch debaz.

Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) refere a fenomèn ke gen diferans nukleotid sèl nan menm pozisyon nan sekans ADN nan moun ki nan menm espès oswa diferan.Ensèsyon, efase, konvèsyon ak envèrsyon yon sèl baz ka tout lakòz diferans sa a.Nan tan lontan an, definisyon SNP te diferan de sa ki nan mitasyon.Yon locus varyant mande pou frekans youn nan alèl yo nan popilasyon an pi gran pase 1% pou yo ka defini kòm yon locus SNP.Sepandan, ak ekspansyon nan teyori byolojik modèn ak aplikasyon an nan teknoloji, frekans alèl se pa yon kondisyon ki nesesè ankò limite definisyon an nan SNP.Dapre done varyasyon nukleotid sèl ki enkli nan baz done Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) anba National Center for Biotechnology Information (NCBI), ensèsyon / efase frekans ba, varyasyon mikrosatellite, elatriye yo enkli tou.

SNP molekilè etikèt ak deteksyon1

Nan kò imen an, frekans SNP se 0.1%.Nan lòt mo, gen yon mwayèn de yon sit SNP pou chak 1000 pè baz.Malgre ke frekans ensidan an relativman wo, se pa tout sit SNP ki ka kandida makè ki gen rapò ak karakteristik.Sa a se sitou ki gen rapò ak kote SNP a rive.

Teyorikman, SNP ka rive nenpòt kote nan sekans genomic la.SNP ki fèt nan rejyon an kodaj ka pwodwi mitasyon sinonim ak mitasyon ki pa sinonim, se sa ki, asid amine yo chanje oswa pa chanje anvan ak apre mitasyon an.Chanje asid amine anjeneral lakòz chèn peptide a pèdi fonksyon orijinal li (mitasyon missense), epi li ka lakòz tou tradiksyon avòtman (mutasyon san sans).SNP ki rive nan rejyon ki pa kode ak rejyon entèjenik yo ka afekte splicing mRNA, konpozisyon sekans RNA ki pa kode, ak efikasite obligatwa faktè transkripsyon ak ADN.Relasyon espesifik yo montre nan figi a:

Kalite SNP:

SNP molekilè etikèt ak deteksyon2

Plizyè metòd komen SNP sezisman ak konparezon yo

Dapre diferan prensip, metòd deteksyon SNP komen yo divize an kategori sa yo:

Konparezon klasifikasyon nan metòd deteksyon

SNP molekilè etikèt ak deteksyon3

Remak: Ki nan lis nan tablo a yo kounye a itilize metòd deteksyon SNP ki pi komen, lòt metòd deteksyon tankou ibridizasyon sit espesifik (ASH), ekstansyon jadendanfan sit espesifik (ASPE), ekstansyon baz sèl (SBCE), koupe sit espesifik (ASC), teknoloji chip jèn, teknoloji mas spèktrometri, elatriye pa te klase ak konpare.

Pri a ak tan nan pirifikasyon asid nikleyè nan pi wo a plizyè metòd komen deteksyon SNP yo inevitab.Sepandan, twous ki gen rapò ki baze sou teknoloji PCR dirèk Foregene ka dirèkteman fè anplifikasyon PCR oswa qPCR sou echantiyon ki pa pirifye, sa ki pote konvenyans san parèy nan deteksyon SNP.

Pwodwi seri PCR dirèk Foregene a tou senpleman ak apeprè omisyon etap pirifikasyon echantiyon, ki redwi anpil tan ak pri ki nesesè pou prepare modèl.Inik Taq polymerase a gen kapasite anplifikasyon ekselan epi li ka tolere yon varyete inibitè nan anviwònman anplifikasyon konplèks.Karakteristik sa yo bay yon garanti teknik pou jwenn pwodwi espesifik segondè-sede.Foregene Direct PCR/qPCR twous pou divès kalite echantiyon, tankou: tisi bèt (ke rat, zebrafish, elatriye), fèy plant, grenn (ki gen ladan polisakarid ak echantiyon polifenol), elatriye.


Tan poste: 23-Jul-2021